Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CcncQ62447 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CcncQ62447 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CcncQ62447 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CcncQ62447 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms