Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rbm38Q62176 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rbm38Q62176 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rbm38Q62176 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm38Q62176 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rbm38Q62176 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rbm38Q62176 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rbm38Q62176 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rbm38Q62176 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm38Q62176 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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