Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga6Q61739 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms