Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde3bQ61409 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde3bQ61409 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde3bQ61409 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms