Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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