Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxg1Q60987 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms