Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms