Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Traf3Q60803 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Traf3Q60803 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms