Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3aQ60520 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms