Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a3Q5XF89 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms