Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Specc1Q5SXY1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms