Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.8 ms