Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms