Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms