Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DroshaQ5HZJ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DroshaQ5HZJ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms