Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC3

Ms4a13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a13Q5FWC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a13Q5FWC3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a13Q5FWC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms