Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms