Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam208bQ5DTT3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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