Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BC100530Q497J0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC100530Q497J0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms