Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt35Q497I4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms