Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap1-4Q3V2D6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms