Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ckap2Q3V1H1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms