Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms