Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn13Q3UW68 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms