Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms