Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms