Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp3Q3ULW8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp3Q3ULW8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms