Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf224Q3UIW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms