Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms