Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx27Q3UHD6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx27Q3UHD6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms