Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgef3Q3UGY8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms