Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms