Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Puf60Q3UEB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms