Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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