Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3TTL0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms