Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17Wsu92eQ3TT38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms