Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms