Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TEI4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms