Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc69Q3TCJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms