Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms