Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms