Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms