Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms