Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700061G19RikQ08EE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms