Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbln1Q08879 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbln1Q08879 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbln1Q08879 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fbln1Q08879 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbln1Q08879 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbln1Q08879 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms