Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnma1Q08460 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms