Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms