Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NrepQ07475 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms