Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms