Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Fmn1Q05860 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fmn1Q05860 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fmn1Q05860 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms